Wordpress3.1ではマルチサイトも強化されました。
ネットワーク管理者が管理画面にログインすると、右上にサイトネットワーク管理者というリンクが追加され、そこからネットワーク管理画面に移動できます。

専用のページが用意されているので一件便利にみえるが慣れないせいかどうもつかいにくいです。
各ページからネットワーク管理者でもプラグインのインストールなどができなくなったのも不便。
上部の管理メニューから参加サイトを選んで移動できるのは便利なんですけどねえ。